WebFeb 24, 2024 · 1. 有关merge函数的问题. merge只是放在一起，fastMNN才是真正的整合分析。 2. 有关PC的选择. Seurat应用JackStraw随机抽样构建一个特征基因与主成分相关性值的背景分布，选择富集特征基因相关性显著的主成分用于后续分析。对大的数据集，这一步计算会比较慢，有时 ... Web这个过程十分的劳动密集型，因为如果在表达谱谱差异明显的cluster中有时候依据单个marker即可鉴定不同的细胞类型，但现实往往是临近cluster的marker谱十分相近，尤其是cluster是在没有很好的降维处理下得出的结果。. 因此，有一个集成的cell注释器十分重要，先 …

R语言Seurat包函数列表及帮助文档 - 爱数吧 - idata8.com

http://www.idata8.com/rpackage/Seurat/FindNeighbors.html WebFindClusters: 聚类分析: FindClusters.default: 聚类分析: FindClusters.Seurat: 聚类分析: FindConservedMarkers: 查找组之间保持不变的标记: FindIntegrationAnchors: 查找集成锚定: FindMarkers: 同一类的基因表达标记: FindMarkers.default: 同一类的基因表达标记: FindMarkers.Seurat: 同一类的基因表达 ... datasus sinasc federal

单细胞实战(5)：复现拟南芥单细胞文章中的数据（1） - 简书

WebAug 6, 2024 · 根据return.neighbor和compute.SNN的设置，该函数可以返回带有KNN信息的neighbor对象，也可以返回带有KNN和SNN的Graph对象列表。当在Seurat 对象上运行时，这将返回带有存储在各自slots中的Graph或Neighbor对象的Seurat对象。图形或邻居对象的名称可以在图形或邻居中找到。 Examples Web2.数据质控. 质控的参数主要有两个： 1.每个细胞测到的unique feature数目（unique feature代表一个细胞检测到的基因的数目，可以根据数据的质量进行调整） 2.每个细胞检测到的线粒体基因的比例，理论上线粒体基因组与核基因组相比，只占很小一部分。 WebApr 10, 2024 · 与Fourier变换相比，小波变换是时间（空间）频率的局部化分析，它通过伸缩平移运算对信号(函数)逐步进行多尺度细化，最终达到高频处时间细分，低频处频率细分，能自动适应时频信号分析的要求，从而可聚焦到信号的任意细节，解决了Fourier变换的困难问 … mary magdalene artemisia gentileschi